本片是一部有喜剧色彩的惊险科幻片，美国一家研究飞行器导航系统的实验室遭非法组织洗劫，一项正在进行的物体微型缩小实验遭受破坏，原本计划注入一只兔子体内的缩小微型飞行器，被项目负责人奥兹博士在被追杀途中注入一个叫杰克·迈克的超市售货员体内。杰克有着间歇性高度兴奋的心理疾病。回到家里，杰克不仅发现有一个来自体内的声音与自己说话，与此同时还遭到不明杀手的追杀。 注入杰克体内的，正是导航系统实验中被微型缩小的一个最尖端的飞行器，飞行器内，“叛逆宇航员”塔克正驾驶被微型缩小的飞行器在杰克体内“遨游”。通过杰克的视网膜和神经系统，塔克不仅能与杰克说话，还能指挥杰克与不明身份的杀手周旋搏斗。由于飞行器内氧气储备最多只能支持到第二天早上九点，要想还原被微型缩小飞行器和飞行器里的塔克，必须找到两快集成电路板中被非法组织拿走的那一块。 在塔克的指挥下，杰克开始寻找非法组织。塔克无意间“看”到迎面走过的两个月前离他而去的女朋友莉迪娅后，指挥杰克引起莉迪娅的注意，使得莉迪娅也加入到行动当中来。莉迪娅是报社记者。最近得知一奇异博士下载个消息，一个叫“牛仔”的惯偷受雇于一个非法组织，目标很有可能就是微型缩小集成电路板。在与杰克的接触中，莉迪娅惊讶于杰克对自己的了解。这种细致入微的了解中，只有有过肌肤之亲的塔克才会知道的。 “牛仔”的目标果然不出莉迪娅所料。发现这个情况后，塔克启动电子模拟系统，对杰克的面部神经进行刺激，将杰克的容貌变成“牛仔”，使得杰克有机会见到藏在幕后的非法组织头目斯克雷蒙。细微的变化被斯克雷蒙发现后，杰克和莉迪娅被斯克雷蒙绑架，好在此时的杰克已经乱中取胜地拿到了被斯克雷蒙拿走的那块电路板。 杰克被推进实验室的那一刻，尽管塔克给杰克以抗争的力量，但依然被斯克雷蒙注射进一个同样微型缩小的飞行器。两个飞行器在杰克的体内相遇，一番交手，塔克占领上风，斯克雷蒙的飞行器在杰克强大胃酸的腐蚀下化为乌有。此时，塔克还原的希望因为飞行器内氧气储备接近极限而面临危险。杰克和莉迪娅飞驰般地赶到导航系统实验室，利用杰克夺回的还原放大集成电路板还原飞行器，不仅挽回一项遭受破坏的科学实验，更挽救了塔克和莉迪娅之间已经走到边缘的爱情。
